肌肉嫩度儀：江口蘿卜豬UCP3 基因變異及其表達(dá)量與肉質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)性分析

   2018年，貴州大學(xué)動物科學(xué)學(xué)院研究人員在國內(nèi)期刊《農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報》在線發(fā)表了題為“江口蘿卜豬UCP3 基因變異及其表達(dá)量與肉質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)性分析"的研究文章。在該論文中，研究人員使用上海騰拔儀器科技有限公司的RTA-Meat肌肉嫩度儀來測定豬肉的剪切力。

  摘要：解耦聯(lián)蛋白3 (uncoupling protein 3, UCP3)作為重要調(diào)控蛋白，主要參與機(jī)體能量代謝調(diào)節(jié)，在脂質(zhì)代謝，脂肪酸氧化和脂肪沉積中起著重要作用，對氧化磷酸化反應(yīng)途徑是否產(chǎn)生ATP起決定性作用。為研究UCP3 基因與豬肉質(zhì)性狀之間的關(guān)系，本研究測定了165 頭江口蘿卜豬(Sus scrofa) 11 項肉質(zhì)性能指標(biāo)，利用混合DNA池擴(kuò)增UCP3 基因全部外顯子，測序篩選SNPs 位點，用單個樣本DNA擴(kuò)增SNPs 位點對應(yīng)外顯子并測序，以驗證位點和分型，分析各位點不同基因型江口蘿卜豬肉質(zhì)性能差異。采用qRTPCR檢測了UCP3 基因在背最長肌中的表達(dá)量，進(jìn)行基因型、肉質(zhì)性能以及基因表達(dá)量的相關(guān)性研究。研究結(jié)果發(fā)現(xiàn)了6 個SNPs 位點，g. 3127A>G、g. 3205T>C、g. 10439C>T、g. 10441C>A、g. 10466G>A、g.10479A>G/T。群體遺傳參數(shù)分析發(fā)現(xiàn)除g.10479A>G/T位點外的其他位點雜合度高，說明群體內(nèi)等位基因分布比較均勻；有效等位基因數(shù)高，表明群體內(nèi)變異程度大；多態(tài)信息含量均大于0.25，為中度多態(tài)，表明位點可以提供一定的遺傳信息。χ2檢驗顯示6 個位點均極顯著偏離Hardy-Weinberg 平衡。連鎖不平衡分析發(fā)現(xiàn)，g. 3127A>G 和g. 3205T>C 位點、g. 10439C>T 和g. 10466G>A 位點為*連鎖不平衡，g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A、g.10479A>G/T 之間為強(qiáng)連鎖不平衡。SNPs 位點與肉質(zhì)的關(guān)聯(lián)性分析發(fā)現(xiàn)g.10479A>G/T位點TT型和GG型個體大理石紋評分顯著高于AA型和AG型個體，剪切力則反之；基因型與背最長肌中UCP3 基因表達(dá)量的關(guān)聯(lián)性分析發(fā)現(xiàn)，g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及g.10479A>G/T 4 個位點上均為突變型個體表達(dá)量極顯著高于另外兩種基因型；UCP3 基因在背最長肌中的表達(dá)量與兩項肉質(zhì)指標(biāo)存在極顯著相關(guān)性，其中與剪切力負(fù)相關(guān)，與肌內(nèi)脂肪含量正相關(guān)。本研究結(jié)果表明，g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及g.10479A>G/T位點為影響江口蘿卜豬肉質(zhì)性能的重要SNPs位點，且UCP3 基因表達(dá)量提高有利于肌內(nèi)脂肪的沉積，此研究結(jié)果為篩選有助于江口蘿卜豬肌內(nèi)脂肪沉積的分子標(biāo)記提供了參考依據(jù)。

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